基于云的ERP系统通常比本地系统更安全。一些企业认为本地ERP系统比基于云的系统更安全，因为在本地系统直接管理数据比把这些数据存放在第三方服务器更安全。
 
但是，这是一个危险的误解，原因如下：
 
• 首先，事实证明云系统比本地系统更可靠。没有哪个系统可以100%保证您的数据安全，最近的研究显示，基于云的电子邮件系统的用户遇到的的恶意软件感染减少了58%，数据丢失或数据泄露事件减少了45%，与安全有关的故障时间减少了45%，审计缺陷减少了93%。这转化为平均每家企业避免损失超过300万美元。
• 虽然理论上使用本地系统可能会保证您的数据充分安全，它需要不断进行设备和软件升级以及IT人员的监控，这会消耗企业很多时间和资源。
• 云服务提供商以它们的声誉做赌注，保护您的数据，就像银行的声誉取决于是否能保护您的金钱。它们因此大举投资安全措施和稳建的网络基础设施，规模上只有最大的软件公司可以匹敌。它们也有全面的服务水平协议来保护您的数据，包括几乎100%的系统正常运行时间的承诺，并遵循各种相关的SSAE、ISO和SOC的标准。企业关心风险时要考虑，使用本地系统实际上是否能匹配最好的云计算服务提供商的安全措施。